Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtbP41155 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtbP41155 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms