Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms