Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb2P27090 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms