Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pou5f1P20263 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms