Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PtpraP18052 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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