Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PolP10400 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PolP10400 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PolP10400 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PolP10400 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PolP10400 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PolP10400 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PolP10400 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms