Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06335 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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P06335 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06335 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P06335 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P06335 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P06335 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06335 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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