Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01725 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01725 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01725 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01725 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms