Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01649 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P01649 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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P01649 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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P01649 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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P01649 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01649 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P01649 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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