Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lnx1O70263 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms