Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TsksO54887 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsksO54887 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsksO54887 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms