Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CrxO54751 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms