Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Clk2O35491 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Clk2O35491 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Clk2O35491 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clk2O35491 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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