Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Slc18a3O35304 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Slc18a3O35304 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Slc18a3O35304 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Slc18a3O35304 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Slc18a3O35304 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Slc18a3O35304 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc18a3O35304 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms