Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pitx3O35160 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms