Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp35M0QWN7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp35M0QWN7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms