Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2056J3QQ02 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms