Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm8356J3QPD3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms