Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim18J3QNP2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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