Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 315.7 ms