Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn20G5E8X0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms