Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vmn1r58G3X9U3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms