Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nccrp1G3X9C2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nccrp1G3X9C2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nccrp1G3X9C2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms