Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer4aF8VPX6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms