Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28048F7BCN0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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