Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cphx3-201ENSMUST00000163305 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Scnn1a-203ENSMUST00000176110 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Bcl6b-201ENSMUST00000000326 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Kcnk2-201ENSMUST00000079451 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cnga2-201ENSMUST00000006020 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Strn-201ENSMUST00000024881 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms