Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Samd1D3YXK1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd1D3YXK1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Samd1D3YXK1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Samd1D3YXK1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Samd1D3YXK1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Samd1D3YXK1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Samd1D3YXK1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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