Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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BC048679D3YXE9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BC048679D3YXE9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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BC048679D3YXE9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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