Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NhsB1AV60 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms