Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Prr29B1ARI9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Prr29B1ARI9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Prr29B1ARI9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prr29B1ARI9 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms