Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2al1jA2BFR3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms