Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtf1A2AQ19 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtf1A2AQ19 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms