Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap5A2AGT5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms