Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Speer3W4VSP1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms