Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt27Q9Z320 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms