Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac6Q9Z2V5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hdac6Q9Z2V5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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