Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Crlf3Q9Z2L7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Crlf3Q9Z2L7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Crlf3Q9Z2L7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Crlf3Q9Z2L7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Crlf3Q9Z2L7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms