Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ilf3Q9Z1X4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms