Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn13Q9Z0S4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms