Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col4a3Q9QZS0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col4a3Q9QZS0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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