Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnnt3Q9QZ47 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms