Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Nr2e3Q9QXZ7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms