Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Limd1Q9QXD8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Limd1Q9QXD8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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