Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfra4Q9JJT2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms