Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms