Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ush1cQ9ES64 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ush1cQ9ES64 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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