Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms