Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clstn1Q9EPL2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clstn1Q9EPL2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms