Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms