Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Xab2Q9DCD2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms